悬浮窗本身不能直接运行指定脚本，但可以通过在悬浮窗中添加按钮或其他交互元素，触发特定的脚本执行。例如，可以在悬浮窗中设置一个按钮，当点击该按钮时，执行相应的脚本逻辑。

如果你需要更具体的实现方式，可以提供更多的需求细节，我可以帮助你进一步解答。